Primeras estimaciones del tamaño del genoma para algunas familias y géneros eudicotiledóneos

Autores/as

  • S. Garcia Institut Botànic de Barcelona (CSIC-ICUB)
  • T. Garnatje Institut Botànic de Barcelona (CSIC-ICUB)
  • O. Hidalgo Department of Environmental and Plant Biology, Ohio University
  • G. Mas De Xaxars Laboratori de Botànica, Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona
  • J. Pellicer Jodrell Laboratory, Royal Botanic Gardens
  • I. Sánchez-Jiménez Institut Botànic de Barcelona (CSIC-ICUB)
  • D. Vitales Laboratori de Botànica, Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona
  • J. Vallès Laboratori de Botànica, Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona

DOI:

https://doi.org/10.3989/collectbot.2010.v29.001

Palabras clave:

cantidades de ADN nuclear, citometría de flujo, eudicotiledóneas, familias de angiospermas, tamaño del genoma, valor C

Resumen


La diversidad del tamaño del genoma en angiospermas es muy amplia, siendo el valor más elevado aproximadamente unas 2400 veces superior al más pequeño. Sin embargo, cerca del 45% de las familias no presentan ni una sola estimación, por lo que el rango real podría ser ampliado. Para contribuir a completar la representación de familias y géneros de angiospermas, este estudio contribuye con valores C para 19 especies de 16 familias de eudicoticotiledóneas, incluyendo los primeros valores para 6 familias, 14 géneros y 17 especies. La muestra estudiada es muy diversa, e incluye hierbas, malezas, enredaderas, arbustos y árboles. Se discuten los resultados en función de estimaciones previas del tamaño del genoma de especies o géneros estrechamente relacionados, del número de cromosomas, la forma de crecimiento o el comportamiento invasor de las especies analizadas. El presente estudio contribuye aproximadamente en un 1,5% de nuevos valores para familias de angiospermas no estudiadas previamente, de las que actualmente existe información para el 55%, según la base de datos de valores C en plantas.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Citas

APG (Angiosperm Phylogeny Group) 2009. An update of the angiosperm phylogeny group classification for the orders and families of flowering plants: APG III. Bot. J. Linn. Soc. 161: 105-121. doi:10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x

Beaulieu, J. M., Smith, J. A. & Leitch, I. J. 2010. On the tempo of genome size evolution in angiosperms. Journal of Botany, vol. 2010, article ID 989152, 8 pages.

Bennett, M. D. & Leitch, I. J. 1995. Nuclear DNA amounts in angiosperms. Ann. Bot. (Oxford) 76: 113-176. doi:10.1006/anbo.1995.1085

Bennett, M. D. & Leitch, I. J. 1997. Nuclear DNA amounts in angiosperms – 583 new estimates. Ann. Bot. (Oxford) 80: 169-196. doi:10.1006/anbo.1997.0415

Bennett, M. D., Leitch, I. J. & Hanson, L. 1998. DNA amounts in two samples of angiosperm weeds. Ann. Bot. (Oxford) 82, Suppl. A: 121-134.

Bennett, M. D., Bhandol, P. & Leitch, I. J. 2000. Nuclear DNA amounts in angiosperms and their modern uses – 807 new estimates. Ann. Bot. (Oxford) 86: 859-909. doi:10.1006/anbo.2000.1253

Bennett, M. D. & Leitch I. J. 2005. Nuclear DNA amounts in angiosperms: progress, problems and prospects. Ann. Bot. (Oxford) 95: 45-90. doi:10.1093/aob/mci003 PMid:15596457

Bennett, M. D. & Leitch, I. J. 2010. Plant DNA C-Values Database. Retrieved Set 28, 2010, from http://www.kew.org/cvalues/

Castro, S., Loureiro, J., Rodriguez, E., Silveira, P., Navarro, L. & Santos, C. 2007. Evaluation of polysomaty and estimation of genome size in Polygala vayredae and P. calcarea using flow cytometry. Pl. Sci. (Elsevier) 172: 1131-1137. doi:10.1016/j.plantsci.2007.03.002

Chase, M. W., Christenhusz, M. J. M., Sanders. D. & Fay, M. F. 2009. Murderous plants: Victorian Gothic, Darwin and modern insights into vegetable carnivory. Bot. J. Linn. Soc. 161: 329-356. doi:10.1111/j.1095-8339.2009.01014.x

Doležel, J., Bartoš, J., Voglmayr, H. & Greilhuber, J. 2003. Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry 51: 127-128.

Ehrendorfer, F. 1982. Speciation patterns in woody angiosperms of tropical origin. In: Barigozzi, C. (Ed.), Mechanisms of Speciation. Alan R. Liss., New York: 479-509.

Galbraith, D. W., Harkins, K. R., Maddox, J. M., Ayres, N. M., Sharma, D. P. & Firoozabady, E. 1983. Rapid flow cytometric analysis of the cell cycle in intact plant tissues. Science 220: 1049-1055. doi:10.1126/science.220.4601.1049 PMid:17754551

Garcia, S., Garnatje, T., Twibell, J. D. & Vallès, J. 2006. Genome size variation in the Artemisia arborescens complex (Asteraceae, Anthemideae) and its cultivars. Genome 49: 244-053. doi:10.1139/G05-105 PMid:16604107

Garcia, S., Canela, M. A., Garnatje, T., McArthur, E. D. M., Pellicer, J., Sanderson, S. C. & Vallès, J. 2008. Evolutionary and ecological implications of genome size in the North American endemic sagebrushes and allies (Artemisia, Asteraceae). Biol. J. Linn. Soc. 94: 631-649. doi:10.1111/j.1095-8312.2008.01001.x

Garnatje T., Canela M. Á., Garcia S., Hidalgo O., Pellicer J., Sánchez-Jiménez I., Siljak-Yakovlev S., Vitales D. & Vallès J. 2010. GSAD: a database on genome size of the family Asteraceae. Retrieved Set 30, 2010, from http://www.etnobiofic.cat/gsad/

Goldblatt, P. & Johnson, D. E. (Eds.). 2010. Index to plant chromosome numbers. Missouri Botanical Garden, St. Louis. Retrieved Oct 7, 2010, from http://mobot.mobot.org/W3T/Search/ipcn.html

Greilhuber, J., Borsch, T., Mu.ller, K., Worberg, A., Poremboski, S., & Barthlott W. 2006. Smallest angiosperm genomes found in Lentibulariaceae with chromosomes of bacterial size. Pl. Biol. (Stuttgart) 8: 770-777.

Groover, A. T. 2005. What genes make a tree a tree? Trends Pl. Sci. 10: 210-214. doi:10.1016/j.tplants.2005.03.001 PMid:15882652

Grotkopp, E., Rejmanek, M., Sanderson, M. J. & Rost, T. L. 2004. Evolution of genome size in pines (Pinus) and its life-history correlates: supertree analyses. Evolution 58: 1705-1729. PMid:15446425

Hanson, L., Boyd, A., Johnson, M. A. T. & Bennett, M. D. 2005. First nuclear DNA C-Values for 18 eudicot families. Ann. Bot. (Oxford) 96: 1315-1320. doi:10.1093/aob/mci283 PMid:16239248

Hanson, L., McMahon, K. A., Johnson, M. A. T. & Bennett, M. D. 2001. First nuclear DNA C-Values for 25 angiosperm families. Ann. Bot. (Oxford) 87: 251-258. doi:10.1006/anbo.2000.1325

Khoshoo, T. N. 1962. Cytogenetical evolution in gymnospermskaryotype. Proceedings of the summer school Darjeeling. Government of India, Darjeeling: 119-135.

Knight, C. A. & Ackerly, D. D. 2002. Variation in nuclear DNA content across environmental gradients: a quantile regression analysis. Ecol. Letters 5: 66-76. doi:10.1046/j.1461-0248.2002.00283.x

Kubešová, M., Moravcová, L., Suda, J., Jarošíik, V. & Pyšek, P. 2010. Naturalized plants have smaller genome size than their non-invading relatives: a flow cytometric analysis of the Czech alien flora. Preslia 81: 81-96.

Leitch, I. J., Beaulieu, J. M., Chase, M. W., Leitch, A. R. & Fay, M. F. 2010. Genome size dynamics and evolution in monocots. Journal of Botany, vol. 2010, article ID 862516, 18 pages, doi 10.1155/2010/862516.

Leitch, I. J. & Hanson, L. 2002. DNA C-Values in seven families fill phylogenetic gaps in the basal angiosperms. Bot. J. Linn. Soc. 140: 175-179. doi:10.1046/j.1095-8339.2002.00096.x

Leitch, I. J., Chase M. W. & Bennett M. D. 1998. Phylogenetic analysis of DNA C-Values provides evidence for a small ancestral genome size in flowering plants. Ann. Bot. (Oxford) 82: 85-94. doi:10.1006/anbo.1998.0783

Leitch, I. J., Soltis, D. E., Soltis, P. S. & Bennett, M. D. 2005. Evolution of DNA amounts across land plants (Embryophyta). Ann. Bot. (Oxford) 95: 207-217. doi:10.1093/aob/mci014 PMid:15596468

Levin, D. A. & Wilson, A. C. 1976. Rates of evolution in seed plants: net increase in diversity of chromosome numbers and species numbers through time. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 73: 2086-2090. doi:10.1073/pnas.73.6.2086

Loureiro, J., Rodriguez, E., Santos, C., Doležel, J. & Suda, J. 2010. FLOWer: A Plant DNA Flow Cytometry Database. Retreived Sep 27, 2010, from http://flower.web.ua.pt/

Lynch, M. 2007. The origins of genome architercture. Sinauer Associates, Sunderland, Massachussets.

Marie, D. & Brown, S. C. 1993. A cytometric exercise in plant DNA histograms, with 2C values for 70 species. Biol. Cell 78: 41-51. doi:10.1016/0248-4900(93)90113-S

Mehra, P. N. 1976. Cytology of Indian hardwoods. Sree Saraswaty Press. Ltd., Calcuta.

Morawetz, W. 1986. Remarks on karyological differentiation patterns in tropical woody plants. Pl. Syst. Evol. 152: 49-100. doi:10.1007/BF00985351

Murray, B. G., De Lange, P. J. & Ferguson, A. R. 2005. Nuclear DNA variation, chromosome numbers and polyploidy in the endemic and indigenous grass flora of New Zealand. Ann. Bot. (Oxford) 96: 1293-1305. doi:10.1093/aob/mci281 PMid:16243852

Ohri, D., Bhargava, A., & Chatterjee, A. 2004. Nuclear DNA amounts in 112 species of tropical hardwoods – new estimates. Pl. Biol. (Stuttgart) 6: 551-561.

Ohri, D. 2005. Climate and growth form: the consequences for genome size in plants. Pl. Biol. (Stuttgart) 7: 449-458. doi:10.1055/s-2005-865878 PMid:16163609

Pellicer, J., Fay, M. F. & Leitch, I. J. 2010. The largest eukaryotic genome of them all? Bot. J. Linn. Soc. 164: 10-15. doi:10.1111/j.1095-8339.2010.01072.x

Petit, R. J. & Hampe, A. 2006. Some evolutionary consequences of being a tree. Annual Rev. Ecol. Evol. Syst. 37: 187-214. doi:10.1146/annurev.ecolsys.37.091305.110215

Siljak-Yakovlev, S., Pustahija, F., Šolić, E. M., Bogunić, F., Muratović, E., Bašić, N., Catrice, O. & Brown, S. C. 2010. Towards a genome size and chromosome number database of Balkan flora: C-Values in 343 taxa with novel values for 242. Adv. Sci. Lett. 3: 190-213.

Soltis, D. E., Soltis, P. S., Bennett, M. D. & Leitch, I. J. 2003. Evolution of genome size in the angiosperms. Amer. J. Bot. 90: 1596-1603. doi:10.3732/ajb.90.11.1596

Stebbins, G. L. 1950. Variation and evolution in plants. Columbia University Press, New York.

Swift, H. H. 1950. The deoxyribose nucleic acid content of animal nuclei. Physiol. Zool. 23: 169-198. PMid:15440320

USDA. 2010. Natural resources conservation service: invasive and noxious weeds. Retrieved Sep 20, 2010, from http://plants.usda.gov/java/noxiousDriver

Zonneveld, B. J. M., Leitch, I. J. & Bennett, M. D. 2005. First nuclear DNA amounts in more than 300 angiosperms. Ann. Bot. (Oxford) 96: 229-244. doi:10.1093/aob/mci170 PMid:15905300

Descargas

Publicado

2010-12-30

Cómo citar

Garcia, S., Garnatje, T., Hidalgo, O., Mas De Xaxars, G., Pellicer, J., Sánchez-Jiménez, I., Vitales, D., & Vallès, J. (2010). Primeras estimaciones del tamaño del genoma para algunas familias y géneros eudicotiledóneos. Collectanea Botanica, 29, 7–16. https://doi.org/10.3989/collectbot.2010.v29.001

Número

Sección

Artículos

Artículos más leídos del mismo autor/a