Primeras medidas del tamaño del genoma en Carduncellusy los géneros afines Femeniasia y Phonus (Asteraceae, Cardueae), con datos para 21 táxones

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.3989/collectbot.2021.v40.004

Palabras clave:

cantidad de ADN, ciclo vital, complejo Carthamus-Carduncellus, nivel de ploidía, poliploidía, valores 2C

Resumen


El tamaño del genoma de 18 especies del género Carduncellus, dos especies de los géneros relacionados, Phonus y el género monotípico Femeniasia (F. balearica) ha sido medido por primera vez mediante citometría de flujo. Los niveles de ploidía se asignaron utilizando datos de tamaño del genoma junto con los recuentos de cromosomas previamente reportados. Se construyó un marco filogenético para visualizar la distribución de las características citogenéticas de los táxones. Los resultados confirmaron tres niveles de ploidía (2x, 4x y 6x), con un predominio de los táxones diploides. Los valores de 2C oscilaron entre 3,24 pg en Carduncellus calvus y 11,16 pg en C. eriocephalus, mientras que el tamaño del genoma monoploide (1Cx) osciló entre 1,29 pg en C. duvauxii (4x) y 2,30 pg en Phonus rhiphaeus (2x). La media de los valores 1Cx para los tetraploides fue menor que para los diploides. Los valores de tamaño del genoma de CarduncellusFemeniasia y Phonus fueron más elevados que los de Carthamus dentro del mismo nivel de ploidía. Este resultado concuerda con una tendencia frecuentemente observada en plantas en la que los táxones con ciclos de vida largos presentan tamaños del genoma más elevados que los táxones relacionados que poseen ciclos de vida cortos.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Citas

Bancheva, S. & Greilhuber, J. 2006. Genome size in Bulgarian Centaurea s.l. (Asteraceae). Plant Systematics and Evolution 257: 95-117. https://doi.org/10.1007/s00606-005-0384-7

Barres, L., Sanmartín, I., Anderson, C. L., Susanna, A., Buerki, S., Galbany-Casals, M. & Vilatersana, R. 2013. Reconstructing the evolution and biogeographic history of tribe Cardueae (Compositae). American Journal of Botany 100: 867-882. https://doi.org/10.3732/ajb.1200058 PMid:23624927

Bureš, P., Wang, Y.-F., Horová, L. & Suda, J. 2004. Genome size variation in central European species of Cirsium (Compositae) and their natural hybrids. Annals of Botany 94: 353-363. https://doi.org/10.1093/aob/mch151 PMid:15292040 PMCid:PMC4242176

Chrtek, Jr. J., Zahradniček, J., Krak, K. & Fehrer, J. 2009. Genome size in Hieracium subgenus Hieracium (Asteraceae) is strongly correlated with major phylogenetic groups. Annals of Botany 104: 161-178. https://doi.org/10.1093/aob/mcp107 PMid:19433417 PMCid:PMC2706716

Darriba, D., Taboada, G. L., Doallo, R. & Posada, D. 2012. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nature Methods 9: 772. https://doi.org/10.1038/nmeth.2109 PMid:22847109 PMCid:PMC4594756

Doležel, J., Bartos, J., Voglmayr, H. & Greilhuber, J. 2003. Nuclear DNA content and genome size of trout and human. Cytometry 51A: 127-128. https://doi.org/10.1002/cyto.a.10013 PMid:12541287

Doležel, J., Binarová, P. & Lucretti, S. 1989. Analysis of nuclear DNA content in plant cells by flow cytometry. Biologia Plantarum 3: 113-120. https://doi.org/10.1007/BF02907241

Garcia, S., Canela M. Á., Garnatje, T., McArthur, E. D., Pellicer, J., Sanderson, S. C. & Vallès, J. 2008. Evolutionary and ecological implications of genome size in the North American endemic sagebrushes and allies (Artemisia, Asteraceae). Biological Journal of the Linnean Society 94: 631-649. https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.2008.01001.x

Garcia, S., Garnatje, T., Twibell, J. D. & Vallès, J. 2006. Genome size variation in the Artemisia arborescens complex (Asteraceae, Anthemideae) and its cultivars. Genome 49: 244-253. https://doi.org/10.1139/g05-105 PMid:16604107

Garnatje, T., Garcia, S. & Canela, M. Á. 2007. Genome size variation from a phylogenetic perspective in the genus Cheirolophus Cass. (Asteraceae): biogeographic implications. Plant Systematics and Evolution 264: 117-134. https://doi.org/10.1007/s00606-006-0489-7

Garnatje, T., Garcia, S., Vilatersana, R. & Vallès, J. 2006. Genome size variation in the genus Carthamus (Asteraceae, Cardueae): Systematic implications and additive changes during allopolyploidization. Annals of Botany 97: 461-467. https://doi.org/10.1093/aob/mcj050 PMid:16390843 PMCid:PMC2803645

Greuter, W. 2003. The Euro+Med treatment of Cardueae (Compositae) - generic concepts and required new names. Willdenowia 33: 49-61. https://doi.org/10.3372/wi.33.33104

Hall, T. A. 1999. BioEdit, A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series 41: 95-98.

Hidalgo, O., Garcia-Jacas, N., Garnatje, T., Romashchenko, K., Susanna, A. & Siljak-Yakovlev, S. 2008. Extreme environmental conditions and phylogenetic inheritance: systematics of Myopordon and Oligochaeta (Asteraceae, Cardueae-Centaureinae). Taxon 57: 769-778. https://doi.org/10.1002/tax.573009

Hidalgo, O., Vitales, D., Vallès, J., Garnatje, T., Siljak-Yakovlev, S., Leitch, I. J. & Pellicer J. 2017. Cytogenetic insights into an oceanic island radiation: The dramatic evolution of pre-existing traits in Cheirolophus (Asteraceae: Cardueae: Centaureinae). Taxon 66: 146-157. https://doi.org/10.12705/661.8

Kapralov, M. V. & Filatov, D. A. 2011. Does large genome size limit speciation in endemic island floras? Journal of Botany 2011: 458684. https://doi.org/10.1155/2011/458684

Leitch, I. J. & Bennett, M. D. 2004. Genome downsizing in polyploid plants. Biological Journal of the Linnean Society 82: 651-663. https://doi.org/10.1111/j.1095-8312.2004.00349.x

López González, G. 1990. Acerca de la clasificación natural del género Carthamus L., s.l. Anales del Jardín Botánico de Madrid 47: 11-34.

López González, G. 2012. Sobre la clasificación del complejo Carthamus-Carduncellus (Asteraceae, Cardueae-Centaureinae) y su tratamiento en Flora iberica. Acta Botanica Malacitana 37: 79-92. https://doi.org/10.24310/abm.v37i0.2669

Pegoraro, L., Baker, E. C., Aeschimann, D., Balant, M., Douzet, R., Garnatje, T., Guignard, M. S., Leitch, I. J., Leitch, A. R., Palazzesi, L., Theurillat, J. P., Hidalgo, O. & Pellicer, J. 2020. The correlation of phylogeny, elevation and ploidy on the incidence of apomixis in Asteraceae of the European Alps. Botanical Journal of the Linnean Society 194: 410-422. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boaa058

Pellicer, J., Garcia, S., Canela, M. Á., Garnatje, T., Korobkov, A. A., Twibell, J. D. & Vallès, J. 2010. Genome size dynamics in Artemisia L. (Asteraceae): following the track of polyploidy. Plant Biology 12: 820-830. https://doi.org/10.1111/j.1438-8677.2009.00268.x PMid:20701707

Pellicer, J., Hidalgo, O., Garnatje, T., Kondo, K. & Vallès, J. 2014. Life cycle versus systematic placement: phylogenetic and cytogenetic studies in annual Artemisia (Asteraceae, Anthemideae). Turkish Journal of Botany 38: 1112-1122. https://doi.org/10.3906/bot-1404-102

Pellicer, J. & Leitch, I. J. 2020. The Plant DNA C-values database (release 7.1): an updated online repository of plant genome size data for comparative studies. New Phytologist 226: 301-305. https://doi.org/10.1111/nph.16261 PMid:31608445

Pires, J. C., Lim, K. Y., Kovařík, A., Matyásek, R., Boyd, A., Leitch, A. R., Leitch, I. J., Bennett, M. D., Soltis, P. S. & Soltis, D. E. 2004. Molecular cytogenetic analysis of recently evolved Tragopogon (Asteraceae) allopolyploids reveal a karyotype that is additive of the diploid progenitors. American Journal of Botany 91: 1022-1035. https://doi.org/10.3732/ajb.91.7.1022 PMid:21653458

Qiu, F., Baack, E. J., Whitney, K. D., Bock, D. G., Tetreault, H. M., Rieseberg, L. H. & Ungerer, M. C. 2019. Phylogenetic trends and environmental correlates of nuclear genome size variation in Helianthus sunflowers. New Phytologist 221: 1609-1618. https://doi.org/10.1111/nph.15465 PMid:30368824

R Core Team 2016. R: a language and environment for statistical computing. Foundation for Statistical Computing, Vienna. Version 3.6.2. Retrieved December 12, 2019, from http://www.R-project.org

Revell, L. J. 2012. phytools: an R package for phylogenetic comparative biology (and other things). Methods in Ecology and Evolution 3: 217-223. https://doi.org/10.1111/j.2041-210X.2011.00169.x

Rice, A., Glick, L., Abadi, S., Einhorn, M., Kopelman, N. M., Salman-Minkov, A., Mayzel, J., Chay, O. & Mayrose, I. 2015. The Chromosome Counts Database (CCDB) - a community resource of plant chromosome numbers. New Phytologist 206: 19-26. Retrieved October 2, 2020, from http://ccdb.tau.ac.il/ https://doi.org/10.1111/nph.13191 PMid:25423910

Ronquist, F., Teslenko, M., Mark, P., Ayres, D., Darling, A., Höhna, S., Larget, B., Liu, L., Suchard, M. A. & Huelsenbeck, J. P. 2012. MrBayes 3.2: Efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biology 61: 539-542. https://doi.org/10.1093/sysbio/sys029 PMid:22357727 PMCid:PMC3329765

Siljak-Yakovlev, S., Godelle, B., Zoldos, V., Vallès, J., Garnatje, T. & Hidalgo, O. 2017. Evolutionary implications of heterochromatin and rDNA in chromosome number and genome size changes during dysploidy: A case study in Reichardia genus. PLoS ONE 12: e0182318. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0182318 PMid:28792980 PMCid:PMC5549912

Suda, J., Krahulcová, A., Trávnícek, P., Rosenbaumová, R., Peckert, T. & Krahulec, F. 2007. Genome size variation and species relationships in Hieracium sub-genus Pilosella (Asteraceae) as inferred by flow cytometry. Annals of Botany 100: 1323-1335. https://doi.org/10.1093/aob/mcm218 PMid:17921526 PMCid:PMC2759259

Suda, J., Kyncl, T. & Freiova, R. 2003. Nuclear DNA amounts in Macaronesian angiosperms. Annals of Botany 92: 153-164. https://doi.org/10.1093/aob/mcg104 PMid:12824074 PMCid:PMC4243629

Torrell, M. & Vallès, J. 2001. Genome size in 21 Artemisia L. species (Asteraceae, Anthemideae): Systematic, evolutionary, and ecological implications. Genome 44: 231-238. https://doi.org/10.1139/gen-44-2-231 PMid:11341733

Trávníček, P., Kirschner, J., Chudáčková, H., Rooks, F. & Štěpánek, J. 2013. Substantial genome size variation in Taraxacum stenocephalum (Asteraceae, Lactuceae). Folia Geobotanica 48: 271-284. https://doi.org/10.1007/s12224-013-9151-7

Vallès, J., Canela, M. Á., Garcia, S., Hidalgo, O., Pellicer, J., Sánchez-Jiménez, I., Siljak-Yakovlev, S., Vitales, D. & Garnatje, T. 2013. Genome size variation and evolution in the family Asteraceae. Caryologia 66: 221-235. https://doi.org/10.1080/00087114.2013.829690

Vilatersana, R. 2002. Delimitació genèrica del complex Carthamus-Carduncellus: un assaig de biosistemàtica i sistemàtica molecular. PhD Thesis, Universitat de Barcelona, Barcelona.

Vilatersana, R., Brysting, A. K. & Brochmann, C. 2007. Molecular evidence for hybrid origins of the invasive polyploids Carthamus creticus and C. turkestanicus (Cardueae, Asteraceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 44: 610-621. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2007.05.008 PMid:17591447

Vilatersana, R., Susanna, A., Garcia-Jacas, N. & Garnatje, T. 2000a. Generic delimitation and phylogeny of the Carduncellus-Carthamus complex (Asteraceae) based on ITS sequences. Plant Systematics and Evolution 221: 89-105. https://doi.org/10.1007/BF01086383

Vilatersana, R., Susanna, A., Garcia-Jacas, N. & Garnatje, T. 2000b. Karyology, generic delineation and dysploidy in the genera Carduncellus, Carthamus and Phonus (Asteraceae). Botanical Journal of the Linnean Society 134: 425-438. https://doi.org/10.1111/j.1095-8339.2000.tb00539.x

Vitales, D., Álvarez, I., Garcia, S., Hidalgo, O., Nieto Feliner, G., Pellicer, J., Vallès, J. & Garnatje, T. 2020. Genome size variation at constant chromosome number is not correlated with repetitive DNA dynamism in Anacyclus (Asteraceae). Annals of Botany 125: 611-623. https://doi.org/10.1093/aob/mcz183 PMid:31697800 PMCid:PMC7103019

Vitales, D., Fernández, P., Garnatje, T. & Garcia, S. 2019. Progress in the study of genome size evolution in Asteraceae: analysis of the last update. Database 2019: baz098. https://doi.org/10.1093/database/baz098 PMid:31608375 PMCid:PMC6790504

Wickham, H. 2016. ggplot2: elegant graphics for data analysis. Springer, New York. https://doi.org/10.1007/978-3-319-24277-4_9

Zahradníček, J., Chrtek, J., Ferreira, M. Z., Krahulcová, A. & Fehrer, J. 2018. Genome size variation in the genus Andryala (Hieraciinae, Asteraceae). Folia Geobotanica 53: 429-447. https://doi.org/10.1007/s12224-018-9330-7

Publicado

2021-06-18

Cómo citar

Garnatje , T. ., Hidalgo, O. ., Vallés, J. ., Garcia, S. ., Romo, Àngel ., & Vilatersana, R. . (2021). Primeras medidas del tamaño del genoma en Carduncellusy los géneros afines Femeniasia y Phonus (Asteraceae, Cardueae), con datos para 21 táxones. Collectanea Botanica, 40, e004. https://doi.org/10.3989/collectbot.2021.v40.004

Número

Sección

Artículos

Datos de los fondos

Ministerio de Economía y Competitividad
Números de la subvención CGL2016-75694-P

Generalitat de Catalunya
Números de la subvención 2017SGR1116

Artículos más leídos del mismo autor/a